米诺地尔常见的副作用包括眼睛发痒、治疗区域发痒、发红或刺激，以及身体其它部位的毛发生长，也有报告称米诺地尔可能脱发恶化。其他副作用可能包括皮疹、瘙痒、呼吸困难、口腔、面部、嘴唇或舌头肿胀、胸痛、头晕、昏厥、心跳过速、头痛、突然且原因不明的体重增加或手和脚肿胀。罕见的副作用包括阳痿、抑郁、焦虑、性冲动减少和皮肤病。暂时的脱发是使用米诺地尔的常见副作用。

存在于某些局部制剂中的酒精和1,2-丙二醇可能会使头皮干燥，导致头皮屑和接触性皮炎。在一些局部米诺地尔制剂中发现的非活性成分1,2-丙二醇产生过敏反应的案例已有报道。